サーバーインスタンス、ベアメタルサーバーのWindowsServer2012 R2に拡張セキュリティ更新プログラム(ESU)を適用することは可能ですか？

はい、適用可能です。ただしSmart Data Platformメニューでの提供は行っておりませんので、お客様にてLicensing Solution Partnerよりご購入ください。