ユーザーごとに、ポータル操作ログ/API実行ログを管理することはできますか？

はい、操作ログ転送機能を利用することでユーザーごとのポータル操作ログ/API実行ログを管理可能です。
詳細は以下ドキュメントをご参照ください。

■操作ログ転送機能
管理機能 – 詳細情報 – 操作ログ転送機能